MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002944	CTG	2	6	167156	167161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
4002	NC_002944	CGG	4	12	167163	167174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406262
4003	NC_002944	GCG	3	9	167215	167223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4004	NC_002944	CGC	2	6	167229	167234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4005	NC_002944	C	6	6	167287	167292	0 %	0 %	0 %	100 %	41406263
4006	NC_002944	GCC	2	6	167325	167330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4007	NC_002944	GCG	2	6	167349	167354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4008	NC_002944	GGT	2	6	167520	167525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4009	NC_002944	CGG	2	6	167529	167534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4010	NC_002944	CAT	2	6	167541	167546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
4011	NC_002944	CAT	2	6	167598	167603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
4012	NC_002944	CGC	2	6	167666	167671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4013	NC_002944	GGCCG	2	10	167673	167682	0 %	0 %	60 %	40 %	41406263
4014	NC_002944	CCG	3	9	167680	167688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4015	NC_002944	GC	3	6	167696	167701	0 %	0 %	50 %	50 %	41406263
4016	NC_002944	CCG	2	6	167707	167712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4017	NC_002944	GCC	2	6	167721	167726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4018	NC_002944	GCCCCC	2	12	167736	167747	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	41406263
4019	NC_002944	GCC	3	9	167748	167756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4020	NC_002944	TTC	2	6	167774	167779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406263
4021	NC_002944	CGC	2	6	167780	167785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4022	NC_002944	CCG	2	6	167794	167799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4023	NC_002944	CGC	2	6	167804	167809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4024	NC_002944	GCG	3	9	167816	167824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4025	NC_002944	CCG	2	6	167828	167833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4026	NC_002944	GCC	2	6	167844	167849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4027	NC_002944	GCC	2	6	167880	167885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4028	NC_002944	CCG	2	6	167890	167895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4029	NC_002944	GC	3	6	167897	167902	0 %	0 %	50 %	50 %	41406263
4030	NC_002944	GTG	2	6	167911	167916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4031	NC_002944	CAT	2	6	167937	167942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
4032	NC_002944	CGC	2	6	167984	167989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4033	NC_002944	CGA	2	6	168006	168011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406263
4034	NC_002944	GC	4	8	168043	168050	0 %	0 %	50 %	50 %	41406263
4035	NC_002944	GTG	2	6	168052	168057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4036	NC_002944	TGCC	2	8	168106	168113	0 %	25 %	25 %	50 %	41406263
4037	NC_002944	CCG	2	6	168125	168130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4038	NC_002944	CG	3	6	168136	168141	0 %	0 %	50 %	50 %	41406263
4039	NC_002944	GCG	2	6	168148	168153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4040	NC_002944	GGT	2	6	168183	168188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4041	NC_002944	GCC	3	9	168193	168201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4042	NC_002944	ACG	2	6	168206	168211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406263
4043	NC_002944	CAA	3	9	168225	168233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406263
4044	NC_002944	CTG	2	6	168247	168252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406263
4045	NC_002944	GGT	2	6	168288	168293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4046	NC_002944	GCG	2	6	168350	168355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4047	NC_002944	CAT	2	6	168414	168419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
4048	NC_002944	CGC	2	6	168428	168433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4049	NC_002944	GCG	2	6	168437	168442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4050	NC_002944	CCG	2	6	168460	168465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4051	NC_002944	GAA	2	6	168480	168485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406263
4052	NC_002944	CGG	2	6	168512	168517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4053	NC_002944	GCG	2	6	168527	168532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406263
4054	NC_002944	GC	3	6	168546	168551	0 %	0 %	50 %	50 %	41406263
4055	NC_002944	CCG	2	6	168613	168618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4056	NC_002944	ACA	2	6	168629	168634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406263
4057	NC_002944	TGG	2	6	168650	168655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406263
4058	NC_002944	CGC	2	6	168663	168668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4059	NC_002944	ATC	2	6	168724	168729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406263
4060	NC_002944	CGC	2	6	168740	168745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4061	NC_002944	CGC	2	6	168749	168754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406263
4062	NC_002944	GGTGCT	2	12	168810	168821	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	41406263
4063	NC_002944	GCA	2	6	168883	168888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4064	NC_002944	CCG	2	6	168890	168895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4065	NC_002944	GGT	2	6	168896	168901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4066	NC_002944	GTGG	2	8	168908	168915	0 %	25 %	75 %	0 %	41406264
4067	NC_002944	GCTG	2	8	168937	168944	0 %	25 %	50 %	25 %	41406264
4068	NC_002944	GGC	2	6	168948	168953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4069	NC_002944	CGC	3	9	168959	168967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4070	NC_002944	TGG	2	6	168979	168984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4071	NC_002944	TGG	2	6	169008	169013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4072	NC_002944	GGC	2	6	169045	169050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4073	NC_002944	CGGC	2	8	169052	169059	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4074	NC_002944	CAA	2	6	169094	169099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406264
4075	NC_002944	CGG	3	9	169106	169114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4076	NC_002944	GGT	2	6	169139	169144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4077	NC_002944	CTG	2	6	169155	169160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4078	NC_002944	CGT	2	6	169226	169231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4079	NC_002944	TGC	2	6	169246	169251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4080	NC_002944	TCGAT	2	10	169273	169282	20 %	40 %	20 %	20 %	41406264
4081	NC_002944	CGT	2	6	169286	169291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4082	NC_002944	CGGCA	2	10	169305	169314	20 %	0 %	40 %	40 %	41406264
4083	NC_002944	C	8	8	169357	169364	0 %	0 %	0 %	100 %	41406264
4084	NC_002944	GCCG	2	8	169369	169376	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4085	NC_002944	GCG	3	9	169453	169461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4086	NC_002944	GCT	2	6	169488	169493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4087	NC_002944	CGGCT	2	10	169555	169564	0 %	20 %	40 %	40 %	41406264
4088	NC_002944	ACC	2	6	169627	169632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406264
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4090	NC_002944	GC	3	6	169689	169694	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4091	NC_002944	CGA	2	6	169695	169700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4092	NC_002944	CGA	2	6	169745	169750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4093	NC_002944	CGC	2	6	169781	169786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4094	NC_002944	GCC	2	6	169822	169827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4095	NC_002944	GCG	2	6	169828	169833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4096	NC_002944	GCC	2	6	169834	169839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4097	NC_002944	GGGC	2	8	169866	169873	0 %	0 %	75 %	25 %	41406264
4098	NC_002944	GCG	2	6	169875	169880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4099	NC_002944	CCG	2	6	169892	169897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4100	NC_002944	GCT	2	6	169959	169964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4101	NC_002944	CG	3	6	169994	169999	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4102	NC_002944	TCG	2	6	170003	170008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4103	NC_002944	CCG	2	6	170009	170014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406264
4104	NC_002944	CGGC	2	8	170048	170055	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4105	NC_002944	CGT	2	6	170127	170132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406264
4106	NC_002944	CCCG	2	8	170141	170148	0 %	0 %	25 %	75 %	41406264
4107	NC_002944	ACC	2	6	170158	170163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406264
4108	NC_002944	GTG	2	6	170170	170175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4109	NC_002944	CGGC	2	8	170230	170237	0 %	0 %	50 %	50 %	41406264
4110	NC_002944	CAC	2	6	170265	170270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406264
4111	NC_002944	ATC	2	6	170305	170310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406264
4112	NC_002944	GGT	2	6	170328	170333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406264
4113	NC_002944	GCG	2	6	170344	170349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406264
4114	NC_002944	GAA	2	6	170352	170357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406264
4115	NC_002944	GCC	2	6	170524	170529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
4116	NC_002944	GCGG	2	8	170534	170541	0 %	0 %	75 %	25 %	41406265
4117	NC_002944	TCG	2	6	170557	170562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
4118	NC_002944	GCG	2	6	170617	170622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406265
4119	NC_002944	CCA	2	6	170656	170661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
4120	NC_002944	ACC	2	6	170682	170687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406265
4121	NC_002944	GCC	2	6	170706	170711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406265
4122	NC_002944	TCACCG	2	12	170740	170751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	41406265
4123	NC_002944	GTC	2	6	170777	170782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
4124	NC_002944	GCT	2	6	170822	170827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
4125	NC_002944	CTG	2	6	170841	170846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406265
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4369	NC_002944	TGA	2	6	179701	179706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406270
4370	NC_002944	GCT	2	6	179714	179719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406270
4371	NC_002944	CGC	2	6	179749	179754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406270
4372	NC_002944	TGG	2	6	179755	179760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406270
4373	NC_002944	CAT	2	6	179771	179776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406270
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4384	NC_002944	GCCG	2	8	180413	180420	0 %	0 %	50 %	50 %	41406270
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4388	NC_002944	CGT	2	6	180545	180550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406270
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4396	NC_002944	TGC	2	6	180871	180876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406270
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4480	NC_002944	GGC	2	6	184463	184468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406275
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4483	NC_002944	ATG	2	6	184544	184549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406275
4484	NC_002944	GCC	2	6	184550	184555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
4485	NC_002944	GCG	3	9	184556	184564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406275
4486	NC_002944	GC	3	6	184581	184586	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4487	NC_002944	GACC	2	8	184588	184595	25 %	0 %	25 %	50 %	41406275
4488	NC_002944	CGC	2	6	184599	184604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
4489	NC_002944	AGC	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4490	NC_002944	CGG	2	6	184732	184737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406275
4491	NC_002944	CTG	2	6	184757	184762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4492	NC_002944	CGT	2	6	184774	184779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4493	NC_002944	CCG	2	6	184815	184820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
4494	NC_002944	TGC	2	6	184836	184841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4495	NC_002944	GC	3	6	184840	184845	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4496	NC_002944	CCGG	2	8	184884	184891	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4497	NC_002944	CCGG	2	8	184915	184922	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4498	NC_002944	CCCG	2	8	184992	184999	0 %	0 %	25 %	75 %	41406275
4499	NC_002944	CGC	2	6	185003	185008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275
4500	NC_002944	CCG	2	6	185012	185017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406275

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